Si faccio anche io così.Io ho fatto così e funziona alla grande, lo uso con FBW.
Ho settato i pannelli per il pop out, centrandoli più o meno su ciascun schermo (PFD, ND, etc.). Li ho poi portati, ridimensionati e bloccati negli schermi di destinazione.
Sul simulatore mi sono creato una visuale in cui i marker del pop out manager rimangono sempre centrati (più o meno) in ciascun pannello.
Prima di avviare il pop out, richiamo la visuale sopra citata e faccio partire lo start. Non sbaglia un colpo.
Mi sono creato la visualizzazione e salvata su Alt+0.
Apro il programma, richiamo visualizzazione e avvio popup dei pannelli.
Ho disattivato il set autopanning.